Ngày 13-5-2008, Ban Lãnh đạo công ty Tân Cảng Sài Gòn đã có cuộc họp với đại diện lãnh đạo Hải Quan TP. Hồ Chí Minh (HQTPHCM) và Hải Quan cửa khẩu cảng Sài Gòn khu vực 1 do các Ông Uông Sỹ Hồng và Ông Trần Mã Thông- Phó Cục trưởng Cục HQTPHCM chủ trì. Trong cuộc họp, hai bên đã thống nhất nhiều nội dung quan trọng. Công Ty Tân Cảng đã đề nghị Hải Quan đã cho phép những container có cảng đích thể hiện trên vận đơn và manifest là “ Ho Chi Minh city port”, “ Tan Cang port”, “ Cat Lai port” có thể được nhận tại Cát Lái hoặc Tân Cảng. Tân Cảng cũng đề nghị Hải Quan tăng cường áp dụng quy trình quản lý rủi ro, giảm tỷ lệ container hàng cần kiểm hóa. Hải Quan cũng đồng ý để Công ty Tân Cảng vận chuyển các container lưu lâu ngày tại Cát Lái về Tân Cảng, trước mắt là vận chuyển những container lưu quá 30 ngày.
Cục HQTPHCM đã đồng ý với những đề nghị của Tân Cảng Sài Gòn và khẳng định sẽ tiếp tục hợp tác giúp đỡ Tân Cảng Sài Gòn. Trong thời gian tới Hải Quan sẽ có những công văn chính thức về vấn đề này.