Để đơn giản hóa thủ tục, giảm thời gian chờ đợi cũng như chi phí cho khách hàng, Tổng Công ty Tân Cảng Sài Gòn đã thống nhất với 3 chi cục Hải quan thuộc Cục Hải quan TPHCM (Chi cục Hải quan cửa khẩu Cảng Sài Gòn Khu vực 1; Chi cục Hải quan quản lý hàng đầu tư; Chi cục Hải quan quản lý hàng gia công) về chủ trương cho phép khách hàng chỉ cần chuyển xác xuất một số container do Hải quan chỉ định cụ thể trong tờ khai hải quan sang bãi kiểm hóa, không cần phải chuyển nguyên lô hàng theo một số hướng dẫn sau đây: